يتكون مجلس إدارة الهيئة من :
| وزير الدفاع | رئيساً |
| نائب وزير الدفاع | عضواً ونائباً للرئيس |
| ممثل من وزارة الشؤون البلدية والقروية | عضواً |
| ممثل من وزارة النقل | عضواً |
| ممثل من وزارة الاقتصاد والتخطيط | عضواً |
| ممثل من وزارة المالية | عضواً |
| ممثل من مدينة الملك عبدالعزيز للعلوم والتقنية | عضواً |
| ممثل من هيئة المساحة الجيولوجية السعودية | عضواً |
| رئيس الهيئة | عضواً |
عضوين من ذوي الاختصاص يختاران لمكانتهما العلمية والمهنية ، وآخرين من القطاع الخاص ، يعينون بقرار من مجلس الوزراء بناءً على ترشيح رئيس مجلس الإدارة لمدة ثلاث سنوات قابلة للتجديد لمرة واحدة .