الهدف من اللجنة التنظيم والإشراف على البحوث العلمية البحرية في المملكة العربية السعودية وتقديم المشورة والتوصيات للجهات المختصة، وتعزيز دور البحث العلمي في دعم التنمية المستدامة للثروات البحرية، إضافة إلى نشر الوعي والثقافة البحرية.
اختصاص اللجنة النظر في طلبات إجراء البحوث العلمية البحرية في المناطق البحرية التابعة للمملكة، والخطط والتوصيات ذات الصلة بالبحث العلمي البحري؛ وفقاً لما نصت عليه لائحة اللجنة.
اقتراح نماذج طلبات الترخيص بإجراء البحوث العلمية البحرية في المناطق البحرية التابعة للمملكة وإقرار تعديلها.
النظر في أي طلب مقدم لإجراء بحث علمي بحري في المناطق البحرية التابعة للمملكة، ودراسته وتحديد مردوده على المملكة، وتقديم التوصية للبت فيه.
اختيار المرشحين السعوديين من ذوي الخبرة والتأهيل المناسب، لمصاحبة فرق البحث المرخص له بالقيام بالبحوث العلمية البحرية.
الإشراف على إعداد الخطط المتعلقة بالأنشطة العلمية والتقنية التي تجري في المناطق البحرية، وخطط البحث العلمي البحري؛ ومتابعة تنفيذ تلك الخطط.
تشجيع نشر الدوريات العلمية المتخصصة بالبحث العلمي البحري وتيسير وصولها للباحثين، وتوثيقها في المكتبات الوطنية.
دراسة الموضوعات ذات الصلة بالبحث العلمي البحري التي يرى سمو وزير الدفاع إحالتها للجنة وتقديم التوصيات بشأنها.